Что такое пцр рнк sars cov 2
ПЦР-диагностика Ковид-19
Пандемия коронавируса, охватившая весь мир, считается наиболее масштабной и опасной за всю историю человечества. Согласно последним данным, на начало декабря 2021 года общее число заболевших превышает 270 миллиона человек, из числа которых свыше 5,3 млн. погибших.
Врачи по всему миру прикладывают максимум усилий, направленных на предотвращение распространения инфекции, а также сокращение смертности среди населения.
Для наилучшей эффективности противоэпидемических мероприятий важно подобрать наиболее экономную и информативную систему тестирования, именно такой является ПЦР-диагностика.
Посредством выделения РНК вируса возможно обнаружить возбудитель в организме человека даже при его минимальной концентрации. Благодаря этому удается начать лечение заблаговременно, предотвратив прогрессирование Ковид-19 до тяжелых форм или убедиться в том, что человек полностью здоров. Сегодня такая возможность имеется и у пациентов нашей клиники.
Принцип проведения ПЦР-диагностики на Ковид-19
ПЦР или полимеразная цепная реакция – современный метод лабораторных исследований, который позволяет с предельной точностью выявлять различные инфекции в организме человека, включая Ковид-19. Результаты анализа максимально точны, исключается даже вариант ложноположительного теста. Однако в отношении COVID-19, в силу новизны и недостаточной изученности вируса, точность ПЦР-диагностики составляла в начале эпидемии порядка 80%. На сегодняшний день точность ПЦР-теста составляет 99.6%.
Суть метода заключается в обнаружении молекул РНК вируса во взятом биологическом материале. В отношении диагностики коронавируса исследуемым биоматериалом становится мазок слизистой ротоглотки и носоглотки.
Особое внимание при этом уделяется именно РНК SARS-CoV-2, то есть рибонуклеиновой кислоте, являющейся носителем генетической информации вируса. Но даже если при первом исследовании РНК вируса не выявлены, подозрения все же могут оставаться (что не связано с возможной погрешностью).
Как известно, инкубационный период в случае Ковид-19 составляет 14 дней, по этой причине полностью исключить болезнь удается после проведения повторной диагностики. При этом все же стоит отметить главное преимущество ПЦР-тестов – это один из самых точных и чувствительных методов диагностики инфекционных заболеваний. Это значит, что проведение даже единичного исследования с высокой долей вероятности даст точный результат и позволит определить, болен ли человек на момент забора биоматериала.
Специфика анализа РНК SARS-CoV-2 (КОВИД, COVID-19)
Анализ на РНК SARS-CoV-2 (КОВИД, COVID-19) можно назвать стандартный ПЦР-тест на коронавирус. В данном случае выполнение исследования занимает 1 день с момента забора биоматериала. В случае положительного результата исследования человек считается инфицированным. Если же РНК коронавируса не выявлена, тест отрицателен, можно с уверенностью говорить о том, что человек не является носителем вируса.
Специфика анализа РНК SARS-CoV-2 (КОВИД, COVID-19) (CITO)
РНК SARS-CoV-2 (КОВИД, COVID-19) (CITO) – схожее по принципу забора биоматериала и методу проведения исследование. Разница заключается лишь в скорости, припиской «CITO» обозначается экспресс-тест, который, в отличие от стандартного метода исследования, проводится в течение нескольких часов. Несмотря на то, что результат будет готов уже спустя 3-4 часа, это не влияет на показатели точности, но такой вариант диагностики обходится дороже.
Особенности забора биоматериала
Процесс забора биоматериала – важнейший этап в ПЦР-диагностике. Крайне важно получить чистый образец, ведь от этого зависит точность и результативность исследования. К счастью, для проведения ПЦР-тестов на Ковид процесс взятия мазка из носоглотки и ротоглотки предельно прост и не требует предварительной подготовки со стороны пациента:
Экспресс-тест NowCheck COVID-19 AG – набор исследований для максимально быстрой и простой диагностики новой коронавирусной инфекции. Тест позволяет выявить антигены COVID-19 в слизи из носоглотки методом ИХА (иммунохроматографии). По точности и достоверности он приближен к анализу ПЦР, но в отличие от него не требует специальных условий и оборудования.
Тест зарегистрирован в реестре медицинских изделий и имеет медицинское регистрационное удостоверение РФ. Метод, который лежит в основе исследования, получил одобрение Министерства здравоохранения России.
Диагностика занимает в среднем 15-30 минут, что позволяет максимально быстро заподозрить коронавирусную инфекцию и принять решение о госпитализации.
Показания к проведению исследования
ПЦР-диагностика коронавируса с предельно высокой на сегодняшний день точностью позволяет получить ответ на конкретный вопрос – болеет ли человек коронавирусом в данным момент. Это исследование не позволяет узнать, переболели вы ранее или нет.
Таким образом, учитывая текущие карантинные меры во многих странах, данный метод диагностики особенно актуален для людей, которые собираются поехать за границу или возвращаются домой.
В таких реалиях показаниями к проведению ПЦР теста являются:
Сертификация
Лаборатория, проводящая данное исследование обладает всеми необходимыми сертификатами для проведения ПЦР-диагностики на COVID-19 (коронавирус). Лабораторные исследования проводятся согласно международным стандартам на современном диагностическом оборудовании.
Заключение о проведенном исследовании выдается пациенту на специальном бланке с печатями, подтверждающими действительность документа.
Что такое пцр рнк sars cov 2
Исследование для выявления коронавируса SARS-CoV-2, которое позволяет с помощью метода полимеразной цепной реакции (ПЦР) определить генетический материал (РНК) вируса в образце биоматериала.
Коронавирусная инфекция, ковид.
COVID-19 PCR test, 2019-nCoV PCR, RNA [polymerase chain reaction, PCR].
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР).
Аналитическая чувствительность тест-системы – 5*10^2 копий (1*10^5 копий/мл).
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Мазок из ротоглотки и носоглотки.
Как правильно подготовиться к исследованию?
Общая информация об исследовании
Коронавирусы – это РНК-содержащие вирусы, на сегодняшний день известно 40 видов. В конце 2019 года был выявлен новый штамм коронавируса – SARS-CoV-2, который вызывает коронавирусную инфекцию COVID-19.
Коронавирусы названы в честь короноподобных шипов на поверхности вируса. У коронавируса SARS-CoV-2 выделяют два подтипа: S и L. S-подтип – более ранний, был сфокусирован в Ухани, вызывает более тяжелое течение заболевание, а L – поздний штамм, распространился по всему миру.
Вирус передается от человека человеку воздушно-капельным, воздушно-пылевым и контактным путем, через рукопожатия и поверхности предметов, на которых он может существовать определенное время. Инкубационный период – до 14 дней, в среднем симптомы появляются на 5-6-е сутки.
Коронавирус тропен к эпителиальным клеткам легких, желудка и кишечника. Поскольку чаще всего «входными воротами» инфекции служат дыхательные пути, то вирус приводит к развитию респираторных симптомов. У большинства заболевших инфекция протекает в легкой форме, носящей симптомы ОРВИ. В группе риска пожилые люди, курильщики и люди с хроническими заболеваниями. У них коронавирусная инфекция может протекать с развитием тяжелой пневмонии и респираторного дистресс-синдрома. У детей заболевание чаще всего протекает в легкой форме.
Молодые люди и дети могут переносить инфекцию бессимптомно, что способствует распространению COVID-19 среди населения.
К основным симптомам относятся:
Реже заболевание проявляется диареей, тошнотой и рвотой.
Диагностика коронавирусной инфекции проводится при помощи метода ПЦР, который позволяет выявить генетический материал вируса в организме.
Для чего используется исследование?
Когда назначается исследование?
Что означают результаты?
Причины положительного результата:
Причины отрицательного результата:
Все пациенты, прибывшие из стран с высоким уровнем распространения COVID-19 или контактировавшие с прибывшими оттуда, а также пациенты с повышенной температурой тела и/или явными симптомами ОРВИ будут направляться для обследования согласно рекомендациям Роспотребнадзора.
Кто назначает исследование?
Инфекционист, педиатр, врач общей практики, анестезиолог-реаниматолог.
Что такое пцр рнк sars cov 2
Своевременная и качественная диагностика – один из ключевых факторов в борьбе с COVID-19: диагностика необходима и для оценки общей эпидемиологической ситуации, и в случае принятия решения по каждому конкретному пациенту. По данным сайта стопкоронавирус.рф на 12.05.2020 г. проведено более более 5,8 миллионов тестов на наличие нового коронавируса. Цифра огромная. Однако, насколько достоверны результаты? Появляется все больше историй о типичной картине COVID-19 при отрицательных анализах. Почему так может происходить?
Сначала поговорим о ПЦР-тестах, которые специфически выявляют РНК вируса в пробах.
Взятие пробы для ПЦР
Показано, что для выявления нового коронавируса подходят смывы из носоглотки – из ротоглотки вероятность ложноотрицательного анализа немного выше [ 1 ]. Один из важнейших аспектов – время взятия материала. Проведенные исследования показывают, что при взятии материала у больного в первый день проявления симптомов COVID-19 положительный диагноз поставят с вероятностью 94 %, а вот к 10-му дню это будет всего лишь 67 %! [ 2 ].
Существует четкая закономерность: чем позже от возникновения симптомов взят материал, тем меньше шансов обнаружить в нем вирусную РНК.
Есть и хорошие новости: в течение первой недели от возникновения симптомов носоглоточные смывы имеют порядок от 100 000 до 1 000 000 копий вирусной РНК в 1 мл, что делает их легко обнаруживаемыми даже не самыми чувствительными системами. Исследования также показали, что вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях может быть одинаковой у людей с проявленной симптоматикой и при бессимптомном течении болезни [ 3 ].
Транспортировка и хранение проб для ПЦР
Точность разных ПЦР-тест-систем
После попадания образцов в лабораторию правильность диагноза будет зависеть во многом от тест-системы, которую там используют. На сегодняшний день помимо двух тест-систем, разработанных еще в январе в ГНЦВБ «Вектор», зарегистрировано 8 ПЦР-тест систем [ 5 ]:
Из них системы «Вектора» и «Вектор-Беста» (последняя через сеть лабораторий «Инвитро» [ 6 ]) используются для исследования проб от государственных медицинских организаций. Здесь хочется отметить, что система «Вектора» не содержит в своем составе внутреннего контрольного образца, который должен добавляться во все пробы для контроля правильности выделения РНК и реакции обратной транскрипции [ 7 ]. Отсутствие такого контроля может также потенциально приводить к некоторому количеству ложноотрицательных результатов. Хорошая новость заключается в том, что остальные зарегистрированные тест-системы имеют в своем составе внутренний контроль, а также, по-видимому, обладают более высокой чувствительностью, т.е. дают меньше ложноотрицательных результатов.
Таким образом, в городах, где представлены сетевые лаборатории, есть возможность сдать анализ частным образом и надеяться на точность проведения процедуры. В первые дни появления симптоматики точность будет выше.
Экспресс-системы
Что касается экспресс-тест-систем, то есть опасения, что созданные в сжатые сроки «уникальные» тесты по своему качеству будут уступать системам, основанным на обычной ПЦР. Насколько надежны эти системы покажет время, однако уже сейчас количество ложноотрицательных результатов ПЦР в совокупности с длительностью ожидания результата привело к тому, что в клиниках страны диагноз стали ставить не на основе ПЦР-анализа, а на основе результатов компьютерной томографии (КТ).
КТ
Преимущество КТ-диагностики при наличии клинической картины – это скорость постановки диагноза и более высокая чувствительность по сравнению с реальностью ПЦР-диагностики: 97,2 % против 83,3 % согласно данным небольшого китайского исследования [ 12 ]. Начиная с 4-5 дня заболевания можно различить так называемый симптом «матового стекла», на стадии прогрессирования такие участки консолидируются, возникает симптом «булыжной мостовой», «обратного ореола», а в пиковая стадии – «белое легкое» [ 13 ]. Возникает закономерный вопрос: отличается ли картина пневмонии, вызванной именно новым коронавирусом, от заболеваний другой вирусной природы. Ответ – нет. Вирусные пневмонии, будь то аденовирус, грипп или другие респираторные вирусы, выглядят на КТ одинаково.
Однако в условиях пандемии, когда подавляющее большинство вирусных пневмоний имеют коронавирусную природу, использование КТ для диагностики становится более чем оправданным. В последней версии методических рекомендаций Минздрава по профилактике, диагностике и лечению COVID-19 указано, что «наличие клинических проявлений в сочетании с характерными изменениями в легких по данным КТ или обзорной рентгенографии органов грудной клетки вне зависимости от результатов однократного лабораторного исследования на наличие РНК SARS-CoV-2 и эпидемиологического анамнеза» является клинически подтвержденным случаем COVID-19 [ 14 ]. Отметим также, что объем поражения легких при РГ и КТ может не иметь прямой корреляции с клинической тяжестью заболевания.
ИФА (иммуноферментный анализ)
ПЦР-тест-системы, как и КТ-диагностика выявляет COVID-19 в острой фазе. Однако весьма актуальна и информация об уже переболевших, на основании которой можно судить об охвате населения заболеванием, а также о числе бессимптомных случаев. Ответы на эти, а также на многие другие вопросы, может дать тест-система на антитела. На сегодняшний день разработкой таких тест-систем помимо «Вектора» занимаются такие организации как «Вектор-Бест», «НПО «Диагностические системы», ФНКЦ ФХМ ФМБА России, «МБС-Технологии», а также «Генетико» и Институт молекулярной биологии РАН [5]. К сожалению, тест-системы на антитела требуют намного больших усилий и времени на разработку, чем ПЦР-системы, а их чувствительность и специфичность оставляет желать лучшего. Так, проведенное в США исследование доступных система на антитела показало, что лишь 3 из 14 систем дают надежные результаты (т.е. не более 1% ложноположительных результатов), но при этом их чувствительность не превышает 90% относительно положительных контрольных образцов [ 15 ]. Какова будет чувствительность и специфичность разрабатываемых российских систем – пока неизвестно.
Итак, самое разумное, что вы можете сказать клиентам:
Регистрируйся на нашем сайте и получай доступ ко в сем материалам о COVID-19 в специальном разделе.
Отвечаем на вопросы в прямых эфирах Вконтакте: https://vk.com/pharmznanie
Обсудить последние новости со всеми коллегами России вы можете в чатах:
Диагностика COVID-19
Виды диагностики COVID
Сегодня, чтобы защитить себя, своих близких и окружающих людей, необходимо знать свой COVID-статус. Особенно если вы продолжаете вести активный образ жизни.
Новый коронавирус SARS-CoV-2 относится к РНК-содержащим вирусам семейства Coronaviridae. Основным источником инфекции является больной человек, в том числе находящийся в инкубационном периоде заболевания.
COVID-19 является подтвержденным при наличии у человека лабораторного подтверждения заболевания, независимо от наличия или отсутствия клинических признаков и симптомов.
Все тесты на SARS-Cov-2 делятся на две категории:
Для обнаружения РНК вируса преимущественно применяется метод полимеразной цепной реакции (ПЦР)- определяет болен ли человек коронавирусом в настоящий момент.
Биологическим материалом для ПЦР-исследования является отделяемое из носоглотки и ротоглотки.
Правильность результата во многом зависит от подготовки к тестированию и забора материала. Поэтому примерно за три часа до анализа не рекомендуется есть или чистить зубы.
Вторая – тесты на определение антител.
Этот вид диагностики является вспомогательным для диагностики текущей коронавирусной инфекции, а также позволяет определить, встречался ли человек с ней ранее.
Эти тесты ищут антитела (IgА, IgМ, IgG) к белкам нуклеокапсида и оболочке вируса.
Антитела класса A (IgA) начинают формироваться и определяются примерно со 2 дня от начала заболевания, достигают пика через две недели, но долго не сохраняются. Антитела класса M (IgM) начинают выявляться примерно на 7-е сутки от заражения, достигают пика через неделю и могут сохраняться в среднем до 6 недель. Примерно со 2-3-й недели определяются антитела класса G(IgG).
Следует учитывать, что не все вырабатываемые антитела одинаково полезны в борьбе с вирусом.
Вирус контактирует с клеткой не всей поверхностью белка, а только его концом, так называемым рецептор-связывающим доменом (Receptor-binding domain, или RBD). Под микроскопом этот домен напоминает шипы.
Исследования показывают, что все анти-RBD антитела, которые вырабатываются при естественной встрече с коронавирусом, являются вируснейтрализующими. То есть они блокируют попадание вируса в клетку, и тем самым защищают уже переболевшего от повторного заболевания.
По наличию антител класса M можно судить о том, что человек недавно был инфицирован вирусом. Антитела класса G говорят, что уже две-три недели прошло с того момента, как человек был инфицирован коронавирусом. Определение анти- RBD-антител выявляет антитела класса G, которые непосредственно нейтрализуют вирус.
Исследование РНК SARS-CoV-2, за 45 мин (c момента поступления биоматериала в лабораторию)
Описание
Внимание! Пройти обследование можно в медицинских офисах по следующим адресам:
по графику приема биоматериала:
пн. – пт. 07:30 – 20:00
сб. – вс. 07:30 – 18:00
Предварительная запись не требуется.
Обращаем Ваше внимание, что срок выполнения исследования составляет 45 минут. Время исследования может быть увеличено в случае технической необходимости проведения повторного исследования.
Срок выполнения теста не включает время поступления биоматериала в лабораторию.
О COVID-19
воздушно-капельным (ведущий путь передачи: при кашле, чихании при разговоре на близком, менее 2 метра, расстоянии),
воздушно-пылевым и контактным путями (во время рукопожатия через поверхности и предметы, заражённые вирусом).
Наиболее распространёнными симптомами заболевания являются: лихорадка, сухой кашель, усталость. Менее часто встречаются ломота в теле, боль в горле, диарея, головная боль, потеря вкуса и/или обоняния, кожная сыпь.
Основным методом лабораторной диагностики, подтверждающим это заболевание, является определение РНК вируса в мазке со слизистой носоглотки и/или ротоглотки с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР).
ПЦР – метод, который позволяет выявить присутствие вируса в организме. За двое суток до появления первых симптомов заболевания и две недели после в дыхательных путях можно обнаружить РНК вируса, после чего он перестает определяться.
Подготовка к исследованию:
ПЦР диагностику рекомендуется проводить до начала приема лекарственных препаратов.
за 3-4 часа до теста рекомендуется прекратить использование лекарственных средств для орошения ротоглотки (зев) /носоглотки (нос) и препаратов для рассасывания;
Не употреблять пищу, не пить, не чистить зубы, не рекомендуется использовать жевательную резинку, курить;
Обращаем Ваше внимание на то, что для диагностики COVID-19 методом ПЦР, а также для регистрации на портале ГосУслуги с целью получения QR-кода, существует перечень обязательных документов.
Заранее необходимо проверить на сайте госуслуг:
Является ли учетная запись подтвержденной.
Правильно ли указаны данные:
ОМС и/или СНИЛС и/или: тип документа + номер документа + серия документа
С целью регистрации заявки, необходимо предоставить подтвержденный на сайте Госуслуг актуальный пакет документов. При смене фамилии и контактных данных необходимо повторно внести актуальные документы на сайт Госуслуг.
В соответствии с письмом Департамента здравоохранения города Москвы от 20.07.2021г. №32-18-170 «О вводе дополнительных данных в ЕМИАС», в целях идентификации и верификации человека, а также передачи результатов анализов с дальнейшим формированием QR-кода в личном кабинете на Едином портале государственных и муниципальных услуг (ЕГПУ), при оформлении заявки на ПЦР-тестирование «COVID-19» в офисе, необходимо предоставлять данные СНИЛС.
Отсутствие этой информации не позволяет осуществить передачу данных на федеральный портал.
Услуга по исследованию РНК SARS-CoV2 (COVID-19) методом ПЦР не оказывается лицам:
Имеющим симптомы острого респираторного заболевания (повышение температуры тела до 37,5 о С и выше, кашель, одышка, ощущение заложенности в грудной клетке, боль в горле, насморк, слабость, головная боль).
У которых ранее выявлен положительный результат лабораторного исследования мазка из носоглотки/ротоглотки на наличие РНК SARS-COV-2, после чего не было пройдено лечение с повторным тестированием и получение отрицательного результата в течение 14 дней с момента получения положительного результата исследования
Услуга по исследованию РНК SARS-CoV2 (COVID-19) методом ПЦР не оказывается анонимно!
Симптомы коронавируса:
— кашель (сухой или с небольшим количеством мокроты)
— нарушение или потеря обоняния
Симптомы схожи с обычными респираторными заболеваниями, могут походить на простуду или грипп.
ПЦР-тестирование рекомендовано:
лицам, окончившим лечение после перенесенной ОРВИ или пневмонии.
лицам, у которых был контакт с больным коронавирусной инфекцией. В случае отсутствия симптомов заболевания тест необходимо сдавать не ранее трех недель после контакта.
с целью исключения бессимптомного протекания заболевания.
для подтверждения факта перенесенной инфекции
ПЦР-исследование позволяет с высокой точностью и в кратчайшие сроки выявить наличие вируса в организме пациента и незамедлительно начать лечение
Исследование на коронавирус методом ПЦР проводится на дому
В случае необходимости проведения теста нескольким людям, проживающим по одному адресу, оформление заявки происходит на каждого пациента.
Результат ПЦР- теста будет отправлен автоматически на русском и английском языках на e-mail, который был указан при регистрации, а также его можно получить самостоятельно, посетив медицинский офис.